Jedním faktorem zabahňování rybníků je bezpochyby intenzivní chov kaprovitých ryb, při kterém do rybníků putuje velké množství organických látek. Přikrmování nebo hnojení rybníků má vliv zejména na lepší přírůstky ryb, a v rozumné formě jsou tyto důvody opodstatněné. Dalším faktor zabahňování však rybáři již neovlivní a způsobuje jim velké nepříjemnosti.

Největším producentem bahna v rybníkách jsou totiž zemědělci, kteří nevhodně obhospodařují svou půdu a pěstují na ní špatné plodiny. Díky tomu, že zemědělské plodiny rostoucí zejména na svažitých polích nedokážou půdu dostatečně zpevnit svých kořenovým systémem, dochází při přívalových deštích k silné erozi. Půda z polí pak spolu s vodou putuje do řek, potoků a rybníků. Nevhodnou plodinou do svažitých terénů je například kukuřice.